La comunidad científica continúa avanzando en la búsqueda de un modo para poner freno a la pandemia del coronavirus, que tras más de dos años continúa, oleada tras oleada, resistiéndose a su fin.

Mientras las vacunas, con dosis de refuerzo incluida, han tenido un impacto positivo frente a los cuadros graves de la covid-19, muchos investigadores continúan afanados en encontrar vías para cortar la transmisión del coronavirus.

Al tiempo en que se siguen desarrollando nuevos sueros y se ponen en marcha medicamentos antivirales como el Paxlovid de Pfizer, el primero de administración oral para luchar contra la covid, los científicos siguen luchando para encontrar nuevas estrategias en esta lucha.

En este contexto, investigadores de la Facultad de Química y del Instituto de Química Teórica y Computacional (IQTC) de la Universidad de Barcelona (UB) señalan, en un trabajo publicado en la revista ‘Journal of Chemical Information and Modeling', que han descubierto cinco moléculas de compuestos naturales que inhiben la proteasa principal –Mpro– del virus SARS-CoV-2, la proteína que ayuda al coronavirus a replicarse.

Dirigido por el catedrático Jaime Rubio Martínez, ello podría ayudar a definir nuevas estrategias terapéuticas en la lucha contra la covid.

Para el desarrollo de este trabajo se ha usado el cribado virtual (in silico), una técnica de análisis computacional para seleccionar moléculas candidatas a futuros fármacos en una biblioteca química. De este modo, han hallado moléculas de productos naturales que son capaces de inhibir el Mpro, la principal proteasa del virus SARS-CoV-2, una proteína no estructural que tiene un papel esencial en la replicación y transcripción de este virus y que se considera una potencial diana terapéutica, ya que si se pudiera inhibir podría evitar la progresión del virus.

En estos momentos el tratamiento de la covid consiste en tratar sus síntomas mediante agentes antiinflamatorios (por ejemplo, la dexametasona o inhibidores de citoquinas) combinados con antibióticos para tratar infecciones secundarias.

Del mismo modo se ha aprobado el antiviral ritonavir, pero todavía hay necesidad de nuevos medicamentos. Por ello, la comunidad científica trabaja en distintas estrategias para identificar compuestos bioactivos que se puedan utilizar como agentes terapéuticos.

En ese punto, el cribado virtual es un procedimiento fiable, rápido y eficiente para descubrir compuestos bioactivos de grandes colecciones químicas contra un objetivo molecular específico o diana, como apunta EFE.

Para esta investigación concreta, los investigadores de la Universidad de Barcelona han realizado un cribado vritual de la base de datos Selleck de productos naturales -una biblioteca química con cerca de 2.000 compuestos- para ver si hay alguna que inhiba la proteasa Mpro del virus SARS-CoV-2, mediante simulaciones y un ensamblaje molecular virtual.

Este método bioinformático, permite predecir y calcular con técnicas computacionales la posición más favorable de interacción entre un ligando y su proteína diana.

Así, como señala EFE, seleccionaron un total de 11 compuestos y probaron in vitro su capacidad de inhibir la proteasa Mpro, concluyendo que hay en concreto cinco candidatos antivirales inhibidores de la proteasa Mpro, y a partir de la base de datos de productos naturales.